Dilawar
2016-10-11 09:50:29 UTC
Jeg har fluorescensoptagelse fra populationen af neuroner prøvevideo på youtube. Problemet er, at kameraet havde vibrationer, hvilket gjorde, at hver ramme skiftede lidt i x-y-retning. Derudover har optagelse støj, men det forbedres.
Jeg leder efter en open source-løsning til at rette op på et sådant skift. Open source-karakteren er obligatorisk, så jeg senere kan udvide den til mine krav. Jeg er fortrolig med python, c / c ++, java og Haskell. Så en løsning på et af disse sprog ville være OK, men præference er for python.
Hvis applikationen er lukket kilde, men uden omkostninger, bør I / O-formatet ikke være passende.
I / O-formater
- Ethvert format, som
ffmpeg/ opencv kan læse på linux-platform (ubuntu / openSUSE) f.eks. tiff, avi, mp4, mkv - Output - Ud over almindelige video- / billedformater er jeg også ok med hdf5-, npy- og python-pickle-format.
Potentielle kandidater
- SIMA - Sekventiel billedanalyse. Det har bevægelsesretning funktionalitet. Open source og pythonbaseret. Det var meget let at installere. Testes i øjeblikket.
Har du noget imod at vise en lille prøve af dine filer for at sikre dig, hvilke data du har? Tak!
Også hvilke input- og outputformater, du kigger på - er input en enkelt videofil eller flere stillbilleder, og skal output være en enkelt video eller flere positionskorrigerede billeder.
Tilføjet en prøvevideo og lidt mere information.